福田站有两个隧道车站，面积14.7万平方米，有21个足球场大，是亚洲最大地下火车站，也是全球第二大地下火车站，仅次于美国纽约中央火车站，而且这是国内第一条采用屏蔽门方式的高铁站，屏蔽门玻璃采用了金刚轨道专用玻璃。车站共设8线4站台，21个出入口，以及12个消防疏散口。

福田站于2008年动工，土建工程已在2012年上半年完成。今天开始联调联试，要两个月时间。预计将在12月31日开通运营，香港段预计要到2017年才开通福田站分三层。车站地下一层为换乘大厅，地下二层为候车大厅，地下三层为站台层。负一层是客流转换层，与高铁、轨道地面交通无缝对接，旅客可以不出地下一层就可以与各种交通实行对接。北段西侧可换成地铁2、3、11号线，东侧可通往地铁4号龙华线市民中心站；南端可直接通往地铁1号罗宝线购物公园站。转换层的东侧与出租车站、公交车同层接驳换乘。下楼负二层是候车层。换乘大厅主要设置了5处扶梯通往地下二层候车区。最主要的2组扶梯位于换乘大厅的中部。其余分布在南北两端的售票处附近。下二层候车区共设置了12个实名制验证口，南北两端各6个。进站检票口共设有8个，分布在候车区中部。出站口设置在南北两端，南端2个出站口A1和 A2, 北端一个出站口B。在这一层设置了无障碍电梯通往站台层，方便旅客进站乘车。负三层是站台，站台层规模为4站台8线，其中4线短站台，长220米；4线长站台，长450米。长站台到香港，短站台来往广州南。其中6、7号站台在连通香港段后可以直接通往香港。站台首次采用全高式屏蔽门。屏蔽门玻璃经过加强设计，采用的是金刚轨道专用玻璃，以应对高铁列车行驶时产生的气压。